[ Evaluation de la diversité moléculaire de quelques descendances hybrides F1 NJM x GVT de cocotier (Cocos nucifera L) en Côte d’Ivoire à l’aide de marqueurs microsatellites ]
Volume 36, Issue 1, April 2022, Pages 54–66
Koffi Eric-Blanchard Zadjéhi1, Thiémélé Deless Edmond Fulgence2, Daramcoum Wentoin Alimata Marie Pierre3, Yao Saraka Didier Martial4, Konan Konan Jean-Louis5, Sié Raoul Sylvère6, and Diarrassouba Nafan7
1 Université Peleforo Gon Coulibaly, UFR Sciences Biologiques, Département de Biochimie-Génétique, Unité Pédagogique et de Recherche (UPR) de Génétique, BP 1328 Korhogo, Côte d’Ivoire
2 Université Peleforo Gon Coulibaly, UFR Sciences Biologiques, Département de Biochimie-Génétique, Unité Pédagogique et de Recherche (UPR) de Génétique, BP 1328 Korhogo, Côte d’Ivoire
3 Université Peleforo Gon Coulibaly, UFR Sciences Biologiques, Département de Biochimie-Génétique, Unité Pédagogique et de Recherche (UPR) de Génétique, BP 1328 Korhogo, Côte d’Ivoire
4 Université Peleforo Gon Coulibaly, UFR Sciences Biologiques, Département de Biochimie-Génétique, Unité Pédagogique et de Recherche (UPR) de Génétique, BP 1328 Korhogo, Côte d’Ivoire
5 CNRA, Station Marc Delorme de Port-Bouët, 07 BP 13 Abidjan 07, Côte d’Ivoire
6 Université Nangui-Abrogoua, 02 BP 801 Abidjan 02, Côte d’Ivoire
7 Université Peleforo Gon Coulibaly, UFR Sciences Biologiques, Département de Biochimie-Génétique, Unité Pédagogique et de Recherche (UPR) de Génétique, BP 1328 Korhogo, Côte d’Ivoire
Original language: French
Copyright © 2022 ISSR Journals. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
This study was conducted to assess the molecular diversity of eight NJM x GVT coconut palm (Cocos nucifera L) hybrid progenies and a BP121+ hybrid control using 15 microsatellite loci. The NJM x GVT hybrids are tolerant to the Lethal yellowing coconut disease when the control is very susceptible to the disease. As a result of this work, 86 alleles were identified at the 15 microsatellite loci with a variation of 2 to 11 alleles per locus. The intra-progeny diversity (HS = 0.50) is higher than the inter-progeny diversity (DST = 0.04). The allelic richness of the progeny ranges from 2.07 to 3.13. The NJM x GVT progenies are molecularly different from the control PB121+. In sum, 63.95% of the alleles present in the NJM x GVT progenies are absent in the BP121+ control. Furthermore, 8.14% of the alleles present in the control are absent in the NJM x GVT hybrids. Collecting samples for further work such as QTLs identification could take these results into account. Thus, it would be wise and advantageous to sample a high number of trees per progeny than to choose several families of progenies. The allelic richness of the progenies could guide the choice of progenies. The markers comprising the private alleles detected between the PB121+ and NJM x GVT progenies can be used in the varietal purity tests.
Author Keywords: Hybrid coconut palm, Lethal yellowing, diversity, microsatellite markers, Côte d’Ivoire.
Volume 36, Issue 1, April 2022, Pages 54–66
Koffi Eric-Blanchard Zadjéhi1, Thiémélé Deless Edmond Fulgence2, Daramcoum Wentoin Alimata Marie Pierre3, Yao Saraka Didier Martial4, Konan Konan Jean-Louis5, Sié Raoul Sylvère6, and Diarrassouba Nafan7
1 Université Peleforo Gon Coulibaly, UFR Sciences Biologiques, Département de Biochimie-Génétique, Unité Pédagogique et de Recherche (UPR) de Génétique, BP 1328 Korhogo, Côte d’Ivoire
2 Université Peleforo Gon Coulibaly, UFR Sciences Biologiques, Département de Biochimie-Génétique, Unité Pédagogique et de Recherche (UPR) de Génétique, BP 1328 Korhogo, Côte d’Ivoire
3 Université Peleforo Gon Coulibaly, UFR Sciences Biologiques, Département de Biochimie-Génétique, Unité Pédagogique et de Recherche (UPR) de Génétique, BP 1328 Korhogo, Côte d’Ivoire
4 Université Peleforo Gon Coulibaly, UFR Sciences Biologiques, Département de Biochimie-Génétique, Unité Pédagogique et de Recherche (UPR) de Génétique, BP 1328 Korhogo, Côte d’Ivoire
5 CNRA, Station Marc Delorme de Port-Bouët, 07 BP 13 Abidjan 07, Côte d’Ivoire
6 Université Nangui-Abrogoua, 02 BP 801 Abidjan 02, Côte d’Ivoire
7 Université Peleforo Gon Coulibaly, UFR Sciences Biologiques, Département de Biochimie-Génétique, Unité Pédagogique et de Recherche (UPR) de Génétique, BP 1328 Korhogo, Côte d’Ivoire
Original language: French
Copyright © 2022 ISSR Journals. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
Abstract
This study was conducted to assess the molecular diversity of eight NJM x GVT coconut palm (Cocos nucifera L) hybrid progenies and a BP121+ hybrid control using 15 microsatellite loci. The NJM x GVT hybrids are tolerant to the Lethal yellowing coconut disease when the control is very susceptible to the disease. As a result of this work, 86 alleles were identified at the 15 microsatellite loci with a variation of 2 to 11 alleles per locus. The intra-progeny diversity (HS = 0.50) is higher than the inter-progeny diversity (DST = 0.04). The allelic richness of the progeny ranges from 2.07 to 3.13. The NJM x GVT progenies are molecularly different from the control PB121+. In sum, 63.95% of the alleles present in the NJM x GVT progenies are absent in the BP121+ control. Furthermore, 8.14% of the alleles present in the control are absent in the NJM x GVT hybrids. Collecting samples for further work such as QTLs identification could take these results into account. Thus, it would be wise and advantageous to sample a high number of trees per progeny than to choose several families of progenies. The allelic richness of the progenies could guide the choice of progenies. The markers comprising the private alleles detected between the PB121+ and NJM x GVT progenies can be used in the varietal purity tests.
Author Keywords: Hybrid coconut palm, Lethal yellowing, diversity, microsatellite markers, Côte d’Ivoire.
Abstract: (french)
Cette étude a été conduite pour évaluer la diversité moléculaire de huit descendances hybrides de cocotier (Cocos nucifera L) NJM x GVT et un témoin hybride BP121+ à l’aide de 15 locus microsatellites. Les hybrides NJM x GVT sont tolérants à la maladie du jaunissement mortel du cocotier, quand le témoin est très sensible à la maladie. A l’issue de ces travaux, 86 allèles ont été identifiés aux 15 loci microsatellites avec une variation de 2 à 11 allèles par locus. La diversité intra descendance (HS = 0,50) est plus élevée que la diversité inter descendance (DST = 0,04). La richesse allélique des descendances varie de 2,07 à 3,13. Les descendances NJM x GVT se différencient au plan moléculaire du témoin PB121+. En somme 63,95 % des allèles présents chez les descendances NJM x GVT sont absents chez le témoin BP121+. Par ailleurs 8,14 % des allèles présents chez le témoin sont absents chez les NJM x GVT. La collecte d’échantillons pour des travaux ultérieurs tels que la recherche de QTLs pourrait prendre en compte ces résultats. Ainsi, il serait judicieux et avantageux d’échantillonner un nombre élevé d’arbres par descendance que de choisir plusieurs familles de descendances. La richesse allélique des descendances pourrait guider dans le choix des descendances. Les marqueurs comportant les allèles privés détectés entre les descendances PB121+ et NJM x GVT peuvent être utilisés dans les tests de pureté variétale.
Author Keywords: Cocotier hybride, Jaunissement mortel, diversité, marqueurs microsatellites, Côte d’Ivoire.
How to Cite this Article
Koffi Eric-Blanchard Zadjéhi, Thiémélé Deless Edmond Fulgence, Daramcoum Wentoin Alimata Marie Pierre, Yao Saraka Didier Martial, Konan Konan Jean-Louis, Sié Raoul Sylvère, and Diarrassouba Nafan, “Assessment of molecular diversity of some F1 NJM x GVT hybrid progenies of coconut palm (Cocos nucifera L) in Côte d'Ivoire using SSR markers,” International Journal of Innovation and Applied Studies, vol. 36, no. 1, pp. 54–66, April 2022.
