[ Diversité et structure génétiques de Clarias anguillaris des bassins des fleuves Niger et Sénégal au Mali ]
Volume 39, Issue 4, June 2023, Pages 1617–1624
Ramata Diop1, Youssouf Sanogo2, Adama Konaté3, Siaka Dembélé4, Sébastino Da Costa Kouassi5, Sognan Dao6, Rokiatou Fané7, Kadiatou Traoré8, Nanourou Dembélé9, Drissa Konaté10, Oumar Ouattara11, Diakaridia Traoré12, and Fassé Samaké13
1 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
2 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
3 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
4 Institut Polytechnique Rural de Formation et de Recherche Appliquée, Koulikoro, Mali
5 Laboratoire d’Ichtyologie et de Conservation des gènes de poissons, Station de Recherche sur la Pêche et l’Aquaculture Continentale, Centre National de Recherche Agronomique, Bouaké, Côte d’Ivoire
6 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
7 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
8 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
9 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
10 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
11 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
12 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
13 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
Original language: French
Copyright © 2023 ISSR Journals. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
Information on genetic diversity is essential in fish conservation programs, the constitution of gene banks and the selection of the most efficient strains. The objective of this contribution is to identify the genetic diversity of wild populations of Clarias anguillaris from river basins in Mali. Eight microsatellite markers (Cba11, Cba19, Cba20, Cga02, Cga06, Cga10, Cm12, Cma17) were used on fins taken from 131 fish. After DNA extraction and PCR amplification, the alleles obtained are separated on a 3% metaphor gel, visualized using the E-Box device. The data was analyzed using Power Marker V3.25 software. The results identified 54 alleles with an average polymorphism information content (PIC) of 0.60. The number of alleles per locus varied between 2 (Cba11) and 10 (Cba19). The rate of heterozygosity was between 0.16±0.07 and 0.14±0.05. The average heterozygosity observed was lower than that of the expected heterozygosity, i.e. 0.16±0.037 versus 0.34±0.04. Three genotypes have been recorded. Group 1 consists of samples from Mopti (Niger Basin) and Lake Magui (Senegal Basin), group 2 those from Sankarani (Niger Basin), Lake Magui and the Bafing and Bakoye rivers (Senegal Basin) and group 3 by those of the Bafing, Bakoye and Sankarani rivers. These results indicate a genetic diversity of the species in the river basins of Mali. The information will serve as guidance in conservation programs for Clarias anguillaris in Mali.
Author Keywords: Clarias anguillaris, genetic diversity, heterozygosity, river basins, Mali.
Volume 39, Issue 4, June 2023, Pages 1617–1624
Ramata Diop1, Youssouf Sanogo2, Adama Konaté3, Siaka Dembélé4, Sébastino Da Costa Kouassi5, Sognan Dao6, Rokiatou Fané7, Kadiatou Traoré8, Nanourou Dembélé9, Drissa Konaté10, Oumar Ouattara11, Diakaridia Traoré12, and Fassé Samaké13
1 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
2 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
3 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
4 Institut Polytechnique Rural de Formation et de Recherche Appliquée, Koulikoro, Mali
5 Laboratoire d’Ichtyologie et de Conservation des gènes de poissons, Station de Recherche sur la Pêche et l’Aquaculture Continentale, Centre National de Recherche Agronomique, Bouaké, Côte d’Ivoire
6 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
7 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
8 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
9 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
10 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
11 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
12 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
13 Laboratoire de Biologie Animale et Environnement, Faculté des Sciences et Techniques, Université des Sciences et Techniques et des Technologies de Bamako, Mali
Original language: French
Copyright © 2023 ISSR Journals. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
Abstract
Information on genetic diversity is essential in fish conservation programs, the constitution of gene banks and the selection of the most efficient strains. The objective of this contribution is to identify the genetic diversity of wild populations of Clarias anguillaris from river basins in Mali. Eight microsatellite markers (Cba11, Cba19, Cba20, Cga02, Cga06, Cga10, Cm12, Cma17) were used on fins taken from 131 fish. After DNA extraction and PCR amplification, the alleles obtained are separated on a 3% metaphor gel, visualized using the E-Box device. The data was analyzed using Power Marker V3.25 software. The results identified 54 alleles with an average polymorphism information content (PIC) of 0.60. The number of alleles per locus varied between 2 (Cba11) and 10 (Cba19). The rate of heterozygosity was between 0.16±0.07 and 0.14±0.05. The average heterozygosity observed was lower than that of the expected heterozygosity, i.e. 0.16±0.037 versus 0.34±0.04. Three genotypes have been recorded. Group 1 consists of samples from Mopti (Niger Basin) and Lake Magui (Senegal Basin), group 2 those from Sankarani (Niger Basin), Lake Magui and the Bafing and Bakoye rivers (Senegal Basin) and group 3 by those of the Bafing, Bakoye and Sankarani rivers. These results indicate a genetic diversity of the species in the river basins of Mali. The information will serve as guidance in conservation programs for Clarias anguillaris in Mali.
Author Keywords: Clarias anguillaris, genetic diversity, heterozygosity, river basins, Mali.
Abstract: (french)
Les informations sur la diversité génétique sont essentielles dans les programmes de conservation des poissons, de la constitution des banques de gènes et la sélection des souches plus performantes. L’objectif de la présente contribution est de relever la diversité génétique des populations sauvages de Clarias anguillaris provenant des bassins fluviaux au Mali. Huit marqueurs microsatellites (Cba11, Cba19, Cba20, Cga02, Cga06, Cga10, Cm12, Cma17) ont été utilisés sur des nageoires prélevées sur 131 poissons. Après l’extraction de l’ADN et amplification par PCR, les allèles obtenus sont séparés sur un gel métaphore de 3%, visualisés à l’aide de l’appareil E-Box. Les données ont été analysées à l’aide du logiciel power marker V3.25. Les résultats ont permis d’identifier 54 allèles avec un contenu moyen d’information sur le polymorphisme (PIC) de 0,60. Le nombre d’allèles par locus a varié entre 2 (Cba11) et 10 (Cba19). Le taux de l’hétérozygotie était entre 0,16±0,07 et 0,14±0,05. La valeur moyenne d’hétérozygotie observée était inférieure à celle de l’hétérozygotie attendue soit 0,16±0,037 contre 0,34±0,04. Trois génotypes ont été enregistrés. Le groupe 1 est constitué des échantillons de Mopti (Bassin du Niger) et du Lac Magui (Bassin du Sénégal), le groupe 2 ceux du Sankarani (bassin du Niger), lac Magui et des rivières Bafing et Bakoye (bassin du Sénégal) et le groupe 3 par ceux des rivières Bafing, Bakoye et Sankarani. Ces résultats indiquent une diversité génétique de l’espèce dans les bassins fluviaux du Mali. Les informations serviront d’orientations dans les programmes de conservation de Clarias anguillaris au Mali.
Author Keywords: Clarias anguillaris, diversité génétique, hétérozygotie, bassins fluviaux, Mali.
How to Cite this Article
Ramata Diop, Youssouf Sanogo, Adama Konaté, Siaka Dembélé, Sébastino Da Costa Kouassi, Sognan Dao, Rokiatou Fané, Kadiatou Traoré, Nanourou Dembélé, Drissa Konaté, Oumar Ouattara, Diakaridia Traoré, and Fassé Samaké, “Genetic diversity and structure of Clarias anguillaris from the Niger and Senegal river basins in Mali,” International Journal of Innovation and Applied Studies, vol. 39, no. 4, pp. 1617–1624, June 2023.
